More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4577 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 141 aa  273  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  55.28 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  55.28 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  59.09 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  59.26 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  57.69 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  54.72 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  61 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 127 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  58.25 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  53.1 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  59.41 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  59.14 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  59.41 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  61.05 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  59.41 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  59.8 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  56.84 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  59.46 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  40.86 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  50.75 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  39.78 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.32 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40.26 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40.26 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  49.32 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.78 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  36.19 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  44.78 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>