More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1714 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  50.43 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  62.04 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  55.43 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  49.46 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  40.52 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.25 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  36.27 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  32.04 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  30.39 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  44.3 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  30.69 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  38.55 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  48.78 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  29.7 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  29.7 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  46.27 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  48.78 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  30.95 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  48 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  47.56 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>