More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4286 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  50.43 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  58.51 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  49 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  47 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  46.08 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  48.48 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  44.09 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  44.58 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  27.55 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  26.73 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.5 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  36.9 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  28.74 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  28.74 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>