More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1821 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0328  transcriptional regulator  58.65 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000496068  hitchhiker  0.00000000000003303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  41.86 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.74 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.53 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.74 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  35.56 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  35.23 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  31.91 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  34.15 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  30.63 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  27.47 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>