More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  55.65 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  55.96 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  51.69 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  52.68 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  53.77 
 
 		 136 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  46.74 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  47.75 
 
 		 135 aa  87.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.34 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.52 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  44.21 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  36.89 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.67 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  36.36 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  35.87 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  42.11 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>