More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0328 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0328  transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000496068  hitchhiker  0.00000000000003303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  35.9 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  35.9 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  32.61 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  32.56 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  29 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  34.74 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  33.7 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  35.71 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  31 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  28.16 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.21 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  29.76 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 324 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>