More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1470 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
119 aa  236  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  49.12 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 
120 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  46.36 
 
 
125 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  45.22 
 
 
118 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  50.45 
 
 
119 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  43.36 
 
 
122 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
127 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
124 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
122 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
119 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
122 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  46.02 
 
 
120 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  39.47 
 
 
125 aa  104  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  41.59 
 
 
121 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
125 aa  103  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
124 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
125 aa  103  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  45.37 
 
 
124 aa  102  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  44.25 
 
 
122 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  45.37 
 
 
124 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
120 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 
123 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  40.87 
 
 
125 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  40.87 
 
 
125 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.74 
 
 
125 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  40.87 
 
 
125 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44.44 
 
 
119 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
125 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
121 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  43.64 
 
 
125 aa  100  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  47.32 
 
 
125 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
117 aa  100  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.44 
 
 
119 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  48.21 
 
 
173 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  41.44 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
139 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  39.83 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 
126 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  44.35 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 
121 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
124 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  37.93 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  36.61 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  40.82 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  46.32 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2795  regulatory protein ArsR  34.86 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2752  regulatory protein, ArsR  34.86 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>