More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3211 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 
111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
116 aa  125  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
110 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 
125 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
100 aa  96.7  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  41.96 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  42.86 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  48.81 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  42.59 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
111 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  43.16 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  52.86 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  54.29 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  41.77 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  41.77 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  36.89 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  52.56 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  47.56 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  50 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.24 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  32.08 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  44 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  50 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  44.16 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.87 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>