More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0245 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
114 aa  226  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  64.58 
 
 
100 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  53.92 
 
 
105 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 
108 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
106 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 
111 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  51.28 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  51.28 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.74 
 
 
112 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.74 
 
 
112 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  46.67 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  38.1 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  33.63 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  45.26 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.67 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  34.95 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  39.47 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  45 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  46.88 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  39.74 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  44.79 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.89 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  34.31 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  35.4 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>