More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1906 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 106 aa  214  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  62.63 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 110 aa  133  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  59.52 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  59.3 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  50.56 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  53.57 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  52.33 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  59.26 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  50.59 
 
 		 114 aa  93.2  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  47.25 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.94 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  54.29 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 230 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.55 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 337 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 349 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  47.14 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 347 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  46.34 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>