More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1441 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 114 aa  239  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  69.51 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  58.97 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  54.32 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  51.81 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 106 aa  93.2  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  51.81 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  49.38 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  46.34 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.18 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  44.3 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 183 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  45.59 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  49.3 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  38.57 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.03 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.03 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.26 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>