More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2204 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  68.78 
 
 		 253 aa  317  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  72.09 
 
 		 221 aa  317  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  59.91 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  43.52 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  43.89 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  47.93 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  45.02 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  43.54 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  41.78 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  40.1 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  41.31 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.1 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  35.2 
 
 		 184 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 114 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 		 124 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 124 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  34.46 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  44.09 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 		 167 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 		 113 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  40.38 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.78 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.91 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.01 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  39.29 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  36.63 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 108 aa  62  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 164 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 98 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 102 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  37.27 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.44 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.23 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>