More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10329 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  441  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  48.85 
 
 
223 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
228 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  45.09 
 
 
227 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 
222 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  43.26 
 
 
221 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
221 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
235 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
235 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
235 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  48.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  44.34 
 
 
226 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
223 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
222 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
226 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
219 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
231 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  44.34 
 
 
218 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
253 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
233 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  44.81 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  43.52 
 
 
223 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  45.5 
 
 
218 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
234 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  42.52 
 
 
232 aa  156  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.64 
 
 
221 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  38.92 
 
 
219 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
224 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
224 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
224 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
224 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
230 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
227 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  37.95 
 
 
221 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  38.84 
 
 
221 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  36.31 
 
 
184 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  37.9 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
124 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  50.96 
 
 
124 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  47.52 
 
 
114 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  54.93 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  40.22 
 
 
423 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  33.87 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.62 
 
 
133 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  42.2 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  50.77 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  38.38 
 
 
132 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
130 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  39.18 
 
 
136 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
171 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
454 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
142 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 
116 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
111 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  40 
 
 
288 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
111 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
172 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
111 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
116 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
113 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 
550 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.84 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.74 
 
 
568 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  36.36 
 
 
137 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 
167 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
143 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 
280 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.2 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.48 
 
 
189 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.42 
 
 
383 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  44.33 
 
 
116 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 
480 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
383 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  52.73 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 
138 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
144 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 
111 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.87 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  55.1 
 
 
125 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
136 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
113 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  46.03 
 
 
459 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
137 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
118 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
137 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.2 
 
 
132 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
161 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
113 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>