More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2691 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  58.26 
 
 
127 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  57.27 
 
 
132 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  58.76 
 
 
132 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  58.76 
 
 
132 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  57.73 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  60.22 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  54.64 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  65.88 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  55.67 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  52.68 
 
 
112 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 
131 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  45.45 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  44.74 
 
 
116 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  44.92 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  47.37 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.06 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  36.7 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  44.59 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  35.96 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  43.24 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.42 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.05 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.05 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  46.84 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  45.57 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.05 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.05 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.05 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.88 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.88 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  45.33 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  46.91 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  45.07 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  46.75 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
220 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
393 aa  66.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  45 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.41 
 
 
813 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  30.69 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  44.05 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.88 
 
 
581 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.02 
 
 
568 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  45.07 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  46.38 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.86 
 
 
361 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  37.18 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
354 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
354 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>