More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1508 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  48.05 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  52.73 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.71 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  51.72 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  32.69 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.68 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  42.86 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.48 
 
 		 116 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  40.58 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.19 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.78 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  42.19 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16570  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  41.18 
 
 		 563 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0975833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.47 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.67 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  40.54 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  38.67 
 
 		 101 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 108 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  52.54 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  40.79 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.18 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  42.47 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.94 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  46.03 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  41.79 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  47.62 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 127 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  41.07 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 107 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  43.75 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.36 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 470 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 107 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 107 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.36 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  35.9 
 
 		 108 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 102 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 97 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.14 
 
 		 550 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40.32 
 
 		 820 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  45 
 
 		 136 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.98 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  36.92 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  30.38 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  33.63 
 
 		 125 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 128 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.84 
 
 		 817 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 		 566 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 130 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  37.5 
 
 		 123 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 98 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 123 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 82 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 459 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  39.44 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 131 aa  52  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 472 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 459 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 459 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 463 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 467 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1554  rhodanese-like sulfurtransferase protein  31.08 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000229638  normal  0.157594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.81 
 
 		 817 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>