More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2892 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  100 
 
 
121 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  72.5 
 
 
121 aa  190  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  56.41 
 
 
121 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  54.7 
 
 
120 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  53.85 
 
 
119 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  52.14 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  52.14 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  52.14 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  53.39 
 
 
119 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  52.14 
 
 
119 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  51.4 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  51.4 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  48.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  49.37 
 
 
108 aa  84.3  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  37.3 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.25 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.3 
 
 
189 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  45.68 
 
 
356 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 
356 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
277 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  46.81 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  42.55 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.22 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  45.57 
 
 
356 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  42.11 
 
 
198 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  44.44 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  38.36 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.48 
 
 
390 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  30.51 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  43.24 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
269 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
279 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
450 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.59 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  37.18 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  43.96 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.39 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.45 
 
 
568 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
271 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.09 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.48 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  35 
 
 
711 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.69 
 
 
377 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
277 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.67 
 
 
711 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.47 
 
 
383 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  37.8 
 
 
201 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.64 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  37.36 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.3 
 
 
201 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  34.13 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  34.78 
 
 
377 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>