More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2613 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  273  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  58.77 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  65.66 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  65.66 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  65.66 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  58.12 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  58.12 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  62.63 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  62 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  60.61 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  60.61 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  55.96 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  61.86 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  49.53 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  53.26 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  52.13 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  48.15 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  53.15 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  50 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  47.56 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  47.56 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  40.59 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  45.78 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  43.06 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  37.96 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.33 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  47.44 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  46.58 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  38.71 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.36 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  45.07 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  38.95 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  45.95 
 
 		 565 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  40.43 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.13 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.45 
 
 		 820 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  44.29 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.89 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.63 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  42.86 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  41.89 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  40.28 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  41.43 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0155  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.96 
 
 		 575 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  44.12 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.62 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  44.12 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.19 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.19 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>