More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0870 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  100 
 
 
131 aa  263  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  39.1 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  42.24 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  47.78 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  42.86 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  37.93 
 
 
685 aa  73.2  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1046  Rhodanese domain protein  40 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  46.91 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  36.19 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  39.33 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  39.32 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.09 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.45 
 
 
568 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  28.07 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  41.56 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  45.21 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  36.99 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  40.79 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  32.54 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  27.69 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  45.59 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.93 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  34.25 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  35 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.9 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  32.58 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  33.63 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  37.17 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  37.17 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.78 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.83 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  30.38 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.64 
 
 
383 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.52 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
222 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  36.23 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33 
 
 
383 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  41.82 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.96 
 
 
269 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
279 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
271 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  29.89 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  36.96 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.11 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  36.96 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  41.67 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  28.09 
 
 
288 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  41.67 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
278 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>