More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3528 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  76.42 
 
 		 107 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  76.42 
 
 		 108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  75.47 
 
 		 107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  75.47 
 
 		 107 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  75.47 
 
 		 107 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  75.47 
 
 		 107 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  74.53 
 
 		 107 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  74.53 
 
 		 107 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  64.49 
 
 		 108 aa  146  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  64.71 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  59.05 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  45.16 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.51 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.3 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  42.05 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  43.96 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.24 
 
 		 550 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  37.78 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  37.78 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.96 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  40.85 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  38.03 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  45.31 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 		 459 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.67 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.19 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  40.91 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0016  GlpE protein  27.5 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  36.11 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 216 aa  57  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  35.37 
 
 		 98 aa  57  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 		 834 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  39.71 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  36.11 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.14 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  34.69 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.27 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.15 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.563654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  39.24 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0155  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.65 
 
 		 575 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  41.77 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  30.86 
 
 		 565 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.23 
 
 		 549 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.21 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 837 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  38.46 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  43.04 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  26.04 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>