More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1199 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  46.01 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  47.44 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  45.26 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.13 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.61 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  32.13 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 129 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 		 129 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  30.74 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  51.32 
 
 		 189 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 		 116 aa  85.9  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  43.3 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.84 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  48.1 
 
 		 103 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 125 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  48.05 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  43.81 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 		 121 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  25.75 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  45 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 		 470 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.86 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  44 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  44.74 
 
 		 124 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.87 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  39.51 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.58 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  39.6 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  32.7 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 460 aa  72.4  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.82 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  40.78 
 
 		 129 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  38.61 
 
 		 148 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.3 
 
 		 837 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  44 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  39.24 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 106 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 113 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  41.46 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.15 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  39.42 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.26 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.26 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  40.26 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.56 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.67 
 
 		 711 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40.48 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.46 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  40.22 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  33.33 
 
 		 118 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  39.13 
 
 		 110 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 116 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 		 113 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  38.71 
 
 		 107 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  41.33 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  36.54 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 133 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.33 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  38.04 
 
 		 109 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  39.13 
 
 		 110 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  41.89 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  42.11 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  41.56 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>