More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5401 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  89.98 
 
 
459 aa  854    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
459 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  89.98 
 
 
459 aa  854    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  93.25 
 
 
459 aa  884    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  941    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  60.92 
 
 
459 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  57.58 
 
 
460 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  56.48 
 
 
461 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  53.19 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  43.3 
 
 
467 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  42.76 
 
 
471 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.42 
 
 
472 aa  355  6.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  43.26 
 
 
470 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  42.32 
 
 
463 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  43.26 
 
 
470 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 
470 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 
466 aa  332  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 
480 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  39.17 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  40.09 
 
 
480 aa  310  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.83 
 
 
471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 
469 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.15 
 
 
471 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
476 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  36.82 
 
 
455 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 
470 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 
617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  38.62 
 
 
479 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 
464 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
444 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  34.92 
 
 
442 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
466 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.13 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  33.13 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.13 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.49 
 
 
478 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 
484 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 
484 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.56 
 
 
478 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  36.29 
 
 
464 aa  247  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  36.15 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 
467 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
444 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
444 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 
476 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 
470 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  33.91 
 
 
456 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 
478 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.48 
 
 
470 aa  239  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.55 
 
 
502 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 
462 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  31.31 
 
 
448 aa  226  8e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  35.73 
 
 
464 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  31.24 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  34.28 
 
 
453 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
453 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  35.19 
 
 
453 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
453 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.56 
 
 
456 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
455 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  34.75 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
488 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  29.84 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
476 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  33.41 
 
 
451 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.04 
 
 
453 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
454 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
470 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
466 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 
244 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
246 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
243 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
243 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  36.77 
 
 
244 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
243 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
243 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  40.1 
 
 
251 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
246 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
246 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
213 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>