More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1444 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  84.85 
 
 		 132 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  97.73 
 
 		 132 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  97.73 
 
 		 132 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  77.44 
 
 		 138 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  75.94 
 
 		 138 aa  199  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  73.19 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  76.69 
 
 		 138 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  68.47 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  60.16 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  59.83 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  56.82 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  57.76 
 
 		 129 aa  141  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  54.39 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  60.2 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  45.63 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.86 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  45.95 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.99 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  51.22 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  41.58 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  45.21 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  48.65 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  47.3 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  40.66 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  43.42 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 82 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  44.04 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 188 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  38.2 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  45.78 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.5 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  33.03 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  40.85 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  44.59 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.1 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  39.45 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 464 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  37.33 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.49 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  38.64 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  43.84 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  41.03 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.65 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.45 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.26 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  42.47 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  43.42 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  43.06 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>