More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2832 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  44.74 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  45.95 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.28 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  35.11 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.25 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.25 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.25 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.25 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.25 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  39.74 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  36.59 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.24 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  39.36 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  45.95 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.18 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  36.23 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.28 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  38.75 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 220 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  48.68 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  42.03 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.3 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  42.86 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  46.84 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  34.72 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  40.26 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.26 
 
 		 566 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.26 
 
 		 566 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  40.58 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  42.03 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  40.79 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40.85 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40.28 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.94 
 
 		 568 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>