More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0323 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  99.07 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  99.07 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  97.2 
 
 		 108 aa  217  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  93.46 
 
 		 107 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  93.46 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  92.52 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  92.52 
 
 		 107 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  74.53 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  71.03 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  63.11 
 
 		 105 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  62.62 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.73 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  41.94 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.66 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  38.24 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.11 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  38.89 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.96 
 
 		 550 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.14 
 
 		 141 aa  66.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.08 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  37.84 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.67 
 
 		 562 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.69 
 
 		 834 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  39.71 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 		 837 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.67 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  37.66 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.77 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0016  GlpE protein  28.75 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.68 
 
 		 277 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.26 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  32 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  37.31 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  32.91 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 		 549 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.24 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.17 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.47 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  38.75 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.84 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  33.66 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  34.72 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  41.33 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.97 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  31.76 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  43.28 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.71 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>