More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1816 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
120 aa  244  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  45.69 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
361 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  44.07 
 
 
126 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.75 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  43.86 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  43.44 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  37.82 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  37.72 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36.72 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36.72 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  36.89 
 
 
136 aa  84.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  36.22 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.33 
 
 
140 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  41.59 
 
 
323 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  44.86 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  43.52 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.66 
 
 
389 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.84 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  33.62 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.54 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  33.62 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  39.34 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.05 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.06 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  39.64 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  34.43 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.43 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  35.11 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.22 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  41.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.76 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  38.52 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  34.71 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  33.06 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.38 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  41.86 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.04 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  40.21 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  35.83 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  35.54 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  38.78 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  41.38 
 
 
201 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  41.38 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  38.14 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.22 
 
 
478 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.67 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.13 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 
478 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
484 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  34.34 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  34.34 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
484 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  34.34 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>