More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1056 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 		 116 aa  243  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  61.11 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  51.43 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  49.02 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  53.15 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  54.55 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  44.33 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  42.06 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  44.86 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  43.93 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  42.73 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  42.99 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  42.99 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  48 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  40.38 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  46.07 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  47.06 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.48 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.05 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  44.87 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  43.96 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  44.78 
 
 		 278 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  41.43 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  35.56 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  45.68 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  46.38 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.95 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.95 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  48.68 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  35.58 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  47.89 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  35.58 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  45.68 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 269 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  41.89 
 
 		 565 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  45.95 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  43.42 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  45.33 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  45.07 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  43.48 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  36.27 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  36.27 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  34.26 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  41.03 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  45.68 
 
 		 390 aa  67.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 		 390 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  41.03 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>