More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1917 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  170  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  50 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  51.43 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.42 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  44.74 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  47.3 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  45.33 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  50 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.47 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  49.23 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.47 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.47 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.47 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.47 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  52.86 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.73 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.56 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  42.67 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  44.29 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  41.89 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  44.29 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  42.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.24 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  50.75 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  46.58 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.43 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  46.67 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.48 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  40 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  46.05 
 
 		 471 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  41.89 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.54 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.65 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  40 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  38.67 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.67 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.1 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  43.84 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.38 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  47.89 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  48 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  41.1 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  42.25 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.84 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.88 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.92 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  44.62 
 
 		 388 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>