More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2943 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  39.32 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  45.07 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.44 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  40.24 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  49.28 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  49.28 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  39.13 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  37.62 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  46.38 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  41.89 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.64 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  39.73 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.39 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  35.78 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  41.43 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  38.67 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  29.81 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.93 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  30.43 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  44.93 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.93 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.93 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  30.84 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  44.93 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  36.99 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  44.93 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  30.84 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  32.61 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  40.54 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  36.11 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  44.05 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.11 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  40.54 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.11 
 
 		 104 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.11 
 
 		 103 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  34.88 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.11 
 
 		 104 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.11 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  39.51 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  39.73 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.96 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.48 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  35.62 
 
 		 598 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.47 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  44.29 
 
 		 478 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  40.45 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  32.05 
 
 		 288 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>