More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0957 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  35.77 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.54 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 141 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  27.41 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.36 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.04 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  30.84 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  38.38 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  38.38 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.34 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  37.08 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.39 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  26.5 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  25 
 
 		 685 aa  60.8  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.98 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.34 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  32.43 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.25 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.34 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.17 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.82 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.69 
 
 		 395 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 656 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  27.64 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.2 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  28.7 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 133 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.12 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  33.33 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.38 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.57 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  28.74 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  28.12 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  29 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.61 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.68 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.9 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  28.36 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.87 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  31 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 		 386 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.87 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>