More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0263 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 116 aa  237  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  63.37 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  52.78 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  51.39 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  48.72 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  38.18 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.4 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  51.52 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  46.43 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  48.68 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  45.57 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  43.75 
 
 		 685 aa  71.6  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  43.06 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.94 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  45.07 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  41.56 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.86 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  45.78 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  45.33 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  44.3 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  42.86 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  41.43 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.25 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.97 
 
 		 581 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  44.59 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  49.21 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  36.17 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.89 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.89 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  40 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.89 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.89 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  41.89 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  37.21 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  42.19 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  43.08 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 		 813 aa  57.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.66 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.24 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  44.16 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>