More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0871 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.71 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.73 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  45 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  37.82 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  46.75 
 
 		 225 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  46.75 
 
 		 225 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  44.93 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  44.93 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  43.48 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.18 
 
 		 711 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  41.98 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.96 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  39.76 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 568 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.17 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.74 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  36.63 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  36.63 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  38.78 
 
 		 711 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  50.79 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  29.6 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.67 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 190 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.55 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  31.54 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  37.04 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  36.25 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.43 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.61 
 
 		 550 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.27 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 189 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  34.45 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  33.33 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.8 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  36.99 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  28.04 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  40.79 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.6 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.03 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.11 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  27.42 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>