More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1955 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  41.48 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.41 
 
 
138 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.96 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.09 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  38.06 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
123 aa  87  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.66 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  36.03 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.06 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  34.06 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  35.82 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  35.17 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.38 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.41 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  30.66 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  29.41 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  30.15 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  30.15 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.27 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  35.29 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  35.29 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  35.29 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  32.61 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  35.9 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  36.19 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  34.06 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  28.99 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  28.99 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  32.99 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.87 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.48 
 
 
378 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  32.85 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  32.17 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  29.93 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  36.19 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>