More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5402 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  99.55 
 
 
221 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  91.58 
 
 
192 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  78.8 
 
 
225 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  78.34 
 
 
225 aa  347  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  61.2 
 
 
199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  57.98 
 
 
194 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  50.52 
 
 
198 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  50.56 
 
 
189 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  55.8 
 
 
197 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  50.88 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  54.25 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  50.98 
 
 
189 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  50.99 
 
 
197 aa  156  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  51.63 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 
190 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  43.1 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  43.53 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
185 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.25 
 
 
182 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  33.52 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.65 
 
 
216 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.31 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  33.51 
 
 
178 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 
175 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
173 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  35.62 
 
 
175 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  44.95 
 
 
711 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  32.78 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.32 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.34112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  30.9 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  30.43 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  30.9 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  30.22 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  30.9 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  30.9 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  30.9 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.5 
 
 
711 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  33.33 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  33.33 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  33.33 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  33.33 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  32.68 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  31.21 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  43.88 
 
 
703 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  43.88 
 
 
703 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  36.47 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.65 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  43.06 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.06 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
142 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
121 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.23 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  28.83 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  28.85 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  41.03 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.78 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  44.74 
 
 
389 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.48 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
102 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 
130 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.11 
 
 
390 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
121 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 
140 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.79 
 
 
472 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.18 
 
 
393 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.63 
 
 
392 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  30.61 
 
 
106 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.5 
 
 
390 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.24 
 
 
116 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>