More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
216 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  40.94 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  40.83 
 
 
225 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 
194 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  40.32 
 
 
199 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  39.88 
 
 
192 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  38.65 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  38.65 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  38.65 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  43.04 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
189 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  40.44 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.67 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  42.77 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  39.25 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  40.12 
 
 
189 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  36.65 
 
 
181 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.4 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 
190 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.13 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.43 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  31.87 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  35.33 
 
 
178 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  36.59 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  36.59 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  36.59 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  36.59 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  36.59 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  35.8 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  32.72 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  32.93 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  36.42 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  32.1 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  32.72 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  32.72 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  32.72 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  32.72 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  32.72 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  32.72 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  36.31 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  44.32 
 
 
703 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  44.32 
 
 
703 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0780  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
133 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.112392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.02 
 
 
711 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  33.86 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  31.01 
 
 
379 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.3 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  42.35 
 
 
132 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  45.1 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
98 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  40.82 
 
 
98 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
110 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 
123 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 
103 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  38.18 
 
 
121 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2878  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
113 aa  58.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  46.97 
 
 
119 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
121 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 
121 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
113 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.64 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.86 
 
 
375 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
125 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
176 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
113 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 
108 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.33 
 
 
282 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  42.72 
 
 
102 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  44.3 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.65 
 
 
136 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  30.08 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  33.66 
 
 
423 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
113 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 
127 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
113 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_006686  CND01140  URM1 activating enzyme, putative  33.33 
 
 
415 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
150 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
122 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
108 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
102 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  32.94 
 
 
119 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  42.62 
 
 
131 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
110 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  30.69 
 
 
391 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  40 
 
 
711 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  38.24 
 
 
119 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 
116 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
126 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>