254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1038 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  99.43 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  99.43 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  99.43 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  98.28 
 
 		 174 aa  346  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  97.7 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  98.28 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  98.26 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  76.3 
 
 		 175 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  76.3 
 
 		 175 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  76.3 
 
 		 175 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  75.72 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  75.72 
 
 		 175 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  59.41 
 
 		 175 aa  207  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  60.59 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  59.41 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  56.32 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  55.23 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  52.02 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  46.41 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  42.01 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  46.86 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  38.75 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.06 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.1 
 
 		 197 aa  90.9  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  31.35 
 
 		 209 aa  87.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.41 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  30.9 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  31.64 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  30.9 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  30.9 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  32.9 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  30.81 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  29.61 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  38.98 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  29.61 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  31.41 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  38.79 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  30.29 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  31.61 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37.62 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.1 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  39.6 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.08 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.08 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.63 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  35.58 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  36.27 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.69 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 108 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 112 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 113 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.09 
 
 		 129 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 108 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  43.4 
 
 		 69 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>