More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2371 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  58.24 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  56.32 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  56.32 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  55.75 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  55.75 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  55.75 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  55.75 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  55.17 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  55.23 
 
 		 172 aa  187  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  55.17 
 
 		 174 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  65.14 
 
 		 176 aa  187  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  54.91 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  54.34 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  54.34 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  54.34 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  55.62 
 
 		 168 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  53.76 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  53.8 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  51.46 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  50.29 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  46.71 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.67 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  42.35 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  32.43 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.85 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.62 
 
 		 221 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 		 221 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  36.18 
 
 		 225 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.97 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  36.18 
 
 		 225 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 		 192 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  33.55 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  34.84 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  42.61 
 
 		 122 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  43.97 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.59 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  34.42 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  42.16 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  42.57 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 113 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  42.61 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.02 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0205  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.04 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  35.48 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  29.46 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  31 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.07 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  37.27 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  31 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 476 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  36.45 
 
 		 320 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  31.73 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  31.73 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.29 
 
 		 379 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 125 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>