More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1184 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  42.33 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  45.11 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  45.11 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  43.1 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  43.1 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  43.1 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  46.1 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  42.16 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  43.1 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  44.13 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  38.22 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  47.02 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.37 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.43 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  38.51 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  39.01 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  37.71 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  37.79 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  36.21 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  39.2 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  39.2 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  39.2 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  39.2 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  38.64 
 
 		 175 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  38.07 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  37.43 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  37.64 
 
 		 178 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  36.36 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  36.36 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  36.36 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  36.36 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  35.8 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  35.8 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.2 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.55 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.43 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  41.41 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  46.81 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  40.4 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  41.07 
 
 		 703 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  35.42 
 
 		 100 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 116 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  41.07 
 
 		 703 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  35 
 
 		 106 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 116 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.02 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.22 
 
 		 711 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.02 
 
 		 379 aa  64.7  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.25 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 102 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  37.74 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.5 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  42.53 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.58 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  34.91 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  34.26 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.64 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 470 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 113 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>