More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1706 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  66.86 
 
 		 189 aa  224  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  61.14 
 
 		 201 aa  210  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  61.11 
 
 		 197 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  48.37 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  51.45 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  53.85 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  53.37 
 
 		 198 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  48.82 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  44.38 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  47.85 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  39.01 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  47.02 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  41.72 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.56 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  46.1 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  39.66 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.22 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 175 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  39.61 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.7 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  36.65 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  36.75 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  34.09 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.43 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.87 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  33.96 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  33.96 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  33.96 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  33.96 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  31.87 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  31.87 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  31.87 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  31.87 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  31.87 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  31.25 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.05 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  32.99 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  32.99 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  36.46 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  38.64 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.05 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  44.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  42.35 
 
 		 711 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  30.49 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  36.47 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.3 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.23 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  40.3 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  30.59 
 
 		 141 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  41.05 
 
 		 703 aa  61.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  41.05 
 
 		 703 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  43.28 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.41 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>