More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1212 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  70.41 
 
 
189 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  59.69 
 
 
201 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  61.11 
 
 
190 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  54.29 
 
 
199 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  51.37 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  50.57 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  48.95 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  48.33 
 
 
225 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  47.78 
 
 
225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  44.89 
 
 
189 aa  160  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  49.18 
 
 
197 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  41.8 
 
 
218 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  45.65 
 
 
198 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
194 aa  144  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  41.62 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  46.88 
 
 
182 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.16 
 
 
197 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.87 
 
 
185 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.8 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  36.26 
 
 
190 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  42.04 
 
 
181 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.66 
 
 
216 aa  97.8  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  35.06 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  41.82 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  33.99 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  30.64 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  33.14 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  33.14 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  33.14 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  33.14 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  45.28 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  42.53 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  33.12 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  31.85 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  29.94 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  34.88 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  34.88 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  33.58 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.42 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  43.56 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.73 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  29.94 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  29.94 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  30.94 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  30.23 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  30.23 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  30.23 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.82 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.78 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.23 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.31 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  43.18 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.26 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.33 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.62 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 
279 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.31 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
140 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.29 
 
 
144 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  40.48 
 
 
113 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.29 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 
100 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
161 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
128 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  40.2 
 
 
393 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 
129 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
269 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  34.65 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
113 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>