More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2516 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  59.01 
 
 		 252 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  33.91 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  32.68 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  30.05 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 432 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  30.05 
 
 		 454 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.33 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  31.32 
 
 		 423 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 406 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  29.61 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.99 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  27.75 
 
 		 535 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  28.64 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  29 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  26.73 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  28.17 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  26.39 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.98 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  26.39 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  28 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  25.43 
 
 		 535 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  27.38 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 123 aa  72  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 459 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.29 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  25.88 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  25.84 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.85 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  26.76 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  42.25 
 
 		 567 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  24.76 
 
 		 527 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 112 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  26.34 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.6 
 
 		 550 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  35.77 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  25.44 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  24.46 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.63 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  39.29 
 
 		 567 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  24.46 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  24.46 
 
 		 555 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  24.46 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  25.35 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  27.75 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  24.46 
 
 		 541 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 		 566 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  27.43 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.79 
 
 		 567 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  31.73 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.16 
 
 		 137 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  27.04 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.19 
 
 		 817 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  24.14 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  37.8 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  36.46 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.62 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  26.87 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 114 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  24.46 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  26.74 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  27.16 
 
 		 548 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.56 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  25 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  22.91 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  26.03 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  25.1 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  37.27 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  30.84 
 
 		 118 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  24.15 
 
 		 545 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 145 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 121 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>