More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0563 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  100 
 
 
121 aa  249  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  72.5 
 
 
121 aa  190  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  55.56 
 
 
121 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  53.39 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  54.31 
 
 
119 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  51.72 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  51.72 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  51.72 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  52.14 
 
 
119 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  51.72 
 
 
119 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  56.38 
 
 
110 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  56.38 
 
 
110 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  52.43 
 
 
130 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.32 
 
 
392 aa  83.6  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  40.83 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  52.05 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  37.11 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  37.27 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.58 
 
 
568 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.62 
 
 
395 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.39 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.86 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  31.36 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  31.36 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  43.59 
 
 
280 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  35.83 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  44.87 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.46 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  42.55 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  49.33 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.3 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  35.05 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0836  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  47.13 
 
 
547 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40.22 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  32.48 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  50.67 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  43.59 
 
 
356 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.87 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  43.59 
 
 
356 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.29 
 
 
562 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.3 
 
 
390 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.3 
 
 
383 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  34.65 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  39.76 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.01 
 
 
383 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  38.04 
 
 
198 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
450 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  36.49 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  48.1 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 
277 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  39.09 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 
377 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  34.09 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.45 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  34.09 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>