More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0788 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  96.26 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  96.26 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  95.33 
 
 		 107 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  95.33 
 
 		 107 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  95.33 
 
 		 107 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  94.39 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  91.59 
 
 		 109 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  90.65 
 
 		 107 aa  202  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  90.65 
 
 		 107 aa  202  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  79.44 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  79.44 
 
 		 107 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  76.64 
 
 		 107 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  57.94 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  61.68 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  55.14 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  54.21 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  54.21 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  53.64 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  55.24 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  52.73 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  55.77 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  53.85 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  52.34 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  51.43 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  51.43 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  50.46 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  49.09 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  51.4 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  50.85 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  49.52 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.72 
 
 		 393 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  46.73 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  45.79 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  52.33 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 		 377 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 		 383 aa  94  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.41 
 
 		 392 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.74 
 
 		 375 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.27 
 
 		 383 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  46.07 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.94 
 
 		 395 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  45 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  53.49 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 		 383 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.86 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  40 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 		 361 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  47.73 
 
 		 308 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  43.37 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 269 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 368 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  36.54 
 
 		 368 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  39.42 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  37.27 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  40 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.14 
 
 		 387 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  40.18 
 
 		 390 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.42 
 
 		 390 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  39.39 
 
 		 391 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  41.11 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  41.11 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  37.65 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.82 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01811  rhodanese-like protein  34.82 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>