More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0162 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 		 216 aa  93.6  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  47.67 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  49.37 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  48.31 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.56 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  48.75 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 277 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  52.05 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  45.33 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.96 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.68 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  49.38 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.25 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.2 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.43 
 
 		 393 aa  76.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  43.69 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  49.28 
 
 		 565 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  38.61 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.09 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  43.04 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  43.62 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  47.3 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  36.63 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  35 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.96 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.84 
 
 		 560 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  34.86 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  41.77 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  41.77 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  42.31 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  46.51 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  40.54 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  40.54 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  40.54 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  44.19 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  45 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 282 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1398  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00125379  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  41.57 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 476 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 		 550 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.68 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  40.54 
 
 		 554 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  43.82 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  40.54 
 
 		 554 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  45.12 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.08 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.08 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  34.48 
 
 		 554 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>