More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3838 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  260  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  48.15 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  46.34 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  47.5 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.88 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  42 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.69 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  35.16 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  44.05 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  41.56 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.99 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.67 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.56 
 
 
550 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  44.87 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  37.04 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 
354 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 
354 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  30.08 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  35.25 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.02 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  30.84 
 
 
356 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  38.61 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  37.5 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  49.23 
 
 
453 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  49.23 
 
 
453 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  49.23 
 
 
453 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  46.97 
 
 
470 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  36.56 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  31.87 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.4 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.7 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  31.87 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  38.27 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.36 
 
 
386 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.71 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  44.32 
 
 
452 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
220 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 
470 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
452 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
480 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  42.35 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  42.53 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
197 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 
471 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  31.46 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  39.73 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  31.46 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>