More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3835 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0205  Rhodanese domain protein  74.34 
 
 
113 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  49.4 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  50.59 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  50.59 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  47.25 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  45.45 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.62 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  47.56 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.43 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  45.98 
 
 
369 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.1 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.24 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  45.12 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  42.57 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
220 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.7 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
471 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  36.19 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  38.46 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  39.8 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  39 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  40.4 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  35.92 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  40.4 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  40.4 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  43.43 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  39.36 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.32 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  38.3 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  43.88 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  30.77 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  40.62 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  40.62 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>