More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3847 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  93.02 
 
 		 129 aa  247  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  54.03 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  53.39 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  57.58 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 220 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  50 
 
 		 288 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 279 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 282 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  46 
 
 		 277 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  52.5 
 
 		 278 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 269 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40.82 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  43 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 480 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  42 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 480 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.61 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  42.06 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  47.37 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.54 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 		 471 aa  77.8  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 484 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.33 
 
 		 478 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.33 
 
 		 478 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 484 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  39.33 
 
 		 478 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.46 
 
 		 478 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  36.19 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38 
 
 		 348 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.74 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.51 
 
 		 568 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.46 
 
 		 550 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.98 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  38.54 
 
 		 455 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.59 
 
 		 817 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.41 
 
 		 389 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  45.35 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  40.22 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.08 
 
 		 478 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 460 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  37.17 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  42.35 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.43 
 
 		 562 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 		 478 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 272 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  36.17 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  49.33 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  36.96 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2271  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  41.57 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.77 
 
 		 711 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.76 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.86 
 
 		 565 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.17 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  33.93 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>