More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0167 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  100 
 
 
117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  53.27 
 
 
113 aa  114  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  53.27 
 
 
113 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  51.46 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  50.47 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  50.47 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  50.47 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  49.51 
 
 
108 aa  105  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  47.12 
 
 
108 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  47.66 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  48.45 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  45.63 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  48.54 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  45.54 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  48.89 
 
 
107 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 
115 aa  87  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.34 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.95 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  42.86 
 
 
110 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  43.64 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  50 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.53 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.35 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  34.78 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.35 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  45.57 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  36.08 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.74 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  40.74 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.18 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  41.33 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.7 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  32.29 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  32.29 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  31.25 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.3 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  31.25 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  44.71 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  37.21 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  39.8 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  44 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  44.16 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.23 
 
 
377 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  44 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.77 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
216 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.14 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 
277 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  36.89 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  35.19 
 
 
423 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>