More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  60.71 
 
 
109 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  61.4 
 
 
115 aa  116  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  59.62 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  60.87 
 
 
107 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  54.81 
 
 
113 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  53.77 
 
 
108 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  57.14 
 
 
110 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  52.54 
 
 
112 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  52.48 
 
 
107 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  54.72 
 
 
108 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  55.34 
 
 
110 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 
115 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  51.38 
 
 
108 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  52.88 
 
 
113 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  51.92 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  49.11 
 
 
111 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  49.11 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  50.51 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  48.54 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  49.51 
 
 
116 aa  91.7  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  57.65 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  49.04 
 
 
110 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  46.79 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  45.87 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  48.6 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  45.87 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  48.84 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  44.34 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  44.95 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  46.59 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.55 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.39 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  50 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  43.27 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  48.94 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.56 
 
 
386 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  49.41 
 
 
186 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  51.19 
 
 
471 aa  77  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  44.19 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.57 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  39.81 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  48.94 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  42.39 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.94 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  48.94 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  45.98 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  37.23 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.23 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  47.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  47.87 
 
 
356 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
269 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  37.23 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  42.2 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  47.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  47.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  43.53 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.62 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.71 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  45.88 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  37 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.24 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.15 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  37 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  47.31 
 
 
357 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  41.86 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 
277 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  40.95 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  36 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>