More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1937 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  78.08 
 
 		 145 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 123 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  44.25 
 
 		 121 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  55.29 
 
 		 113 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  51.58 
 
 		 111 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  55.29 
 
 		 113 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  51.69 
 
 		 138 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  43.97 
 
 		 144 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 103 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 142 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  47.83 
 
 		 132 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 		 480 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  40.17 
 
 		 148 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 		 111 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  46.24 
 
 		 142 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  45.26 
 
 		 116 aa  89  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  43.27 
 
 		 137 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  44.09 
 
 		 105 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  49.04 
 
 		 115 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  50.6 
 
 		 113 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 129 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  42 
 
 		 480 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 141 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  38.24 
 
 		 141 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 145 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.05 
 
 		 170 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 141 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  51.76 
 
 		 113 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.79 
 
 		 114 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 		 130 aa  85.5  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  44.71 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 		 138 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.96 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 		 123 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  48.1 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 		 113 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  41.44 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  48.1 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  49.41 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  45.68 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  48.24 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  40.54 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  36.63 
 
 		 118 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 		 141 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 118 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 140 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 141 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 141 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  49.33 
 
 		 107 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.67 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  35.9 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  35.96 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  45.45 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  44.94 
 
 		 120 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 148 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  46 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 		 125 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 98 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  43.18 
 
 		 129 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  43.9 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 106 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.16 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 102 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.86 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  47.06 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  46.15 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  45.33 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.13 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.68 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 		 469 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>