More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0428 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  100 
 
 
116 aa  238  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.92 
 
 
392 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.19 
 
 
390 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.12 
 
 
375 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  45.19 
 
 
390 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.28 
 
 
395 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.25 
 
 
387 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.27 
 
 
390 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.93 
 
 
383 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  48.91 
 
 
145 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.11 
 
 
386 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  47.47 
 
 
105 aa  92  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.86 
 
 
377 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
269 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.93 
 
 
398 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  44.34 
 
 
106 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  46.81 
 
 
121 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  49.49 
 
 
201 aa  87  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.59 
 
 
393 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.99 
 
 
390 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
562 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 
392 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.38 
 
 
390 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.45 
 
 
383 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.62 
 
 
386 aa  84.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 
99 aa  84.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  40.95 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  45.28 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  46.39 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.42 
 
 
390 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  43.64 
 
 
423 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.62 
 
 
386 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.27 
 
 
561 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 
383 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  37.62 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  44 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.94 
 
 
567 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.23 
 
 
189 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  35.59 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  35.59 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.66 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.62 
 
 
393 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 
558 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  44.32 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 
220 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.55 
 
 
568 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  42.11 
 
 
173 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  37.38 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  40.91 
 
 
390 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 
395 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  38.64 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  38.64 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 
392 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  42.86 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  36.67 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  39.56 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  41.84 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  42.27 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  40.91 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  39.64 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  39.77 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  39.77 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  40.91 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  39.77 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  41.24 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.79 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  38.3 
 
 
377 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  38.64 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  38.64 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  40 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>